Clitemnestra va ser l'esposa d'Agamèmnon, rei de Micenes , amb el qual va tenir tres fills: Electra, Ifigenia i Orestes.
Va néixer dels ous postos per la seva mare després de la violació de Zeus i la posterior relació amorosa amb Tíndar. Els prínceps de Micenes, Agamèmnon i Menelau, foren acollits al seu palau d'Esparta Al cap d'un temps, Clitemnestra fou concedida a Agamèmnon com a esposa.
Quan tota la flota aquea estava al port d'Àulide, disposada a partir a lluitar a la guerra de Troia, Agamèmnon s'havia guanyat la còlera de la deessa Àrtemis. Per això la flota estava aturada sense poder partir-ne per l'absència de vents favorables.
L'endeví Calcant fou interrogat per saber com aplacar la deessa, i la resposta fou que s'havia de sacrificar la filla més formosa d'Agamèmnon en nom de la deessa Àrtemis, perquè aquesta els deixés partir. El rei al principi s'hi negà, però pressionat pel seu germà Menelau, hagué d'enviar un missatge a Clitemnestra perquè li fes enviar la seva filla Ifigènia des de Micenes fins a Àulide amb el pretext de casar-la amb Aquil·leu. Després, Agamèmnon tractà d'impedir el sacrifici enviant secretament una altra carta a Clitemnestra en la que li deia que no enviés la seva filla, però aquesta carta fou interceptada i no arribà a la seva destinació. En no haver-hi cap altra solució, Agamèmnon consintí en fer el sacrifici de la seva filla.